Đây là cơ sở quan trọng cho việc thu phí bảo vệ môi trường đối với nước thải theo Nghị định 67/2003/NĐ-CP. Quyết định và Thông tư sắp ban hành sẽ hướng dẫn cụ thể phương pháp xác định khối lượng chất gây ô nhiễm theo định mức phát thải. Số liệu để áp dụng cho Bản định mức đầu tiên (năm 2008) sẽ được lấy từ các tài liệu nước ngoài có kiểm chứng thực tế đối với một số sản phẩm ở nước ta. Sau đó, trong các phiên bản tiếp theo sẽ tiến hành lấy mẫu và phân tích nước thải trực tiếp tại các cơ sở công nghiệp và xác định định mức để bổ sung, cập nhật. Hàng năm, Bộ TN&MT sẽ công bố bản định mức mới.